Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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Trpc3Q9QZC1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Trpc3Q9QZC1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Trpc3Q9QZC1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Trpc3Q9QZC1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
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Trpc3Q9QZC1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Trpc3Q9QZC1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Trpc3Q9QZC1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Trpc3Q9QZC1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Trpc3Q9QZC1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc3Q9QZC1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc3Q9QZC1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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