Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr4a3Q9QZB6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a3Q9QZB6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a3Q9QZB6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a3Q9QZB6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a3Q9QZB6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a3Q9QZB6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a3Q9QZB6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a3Q9QZB6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a3Q9QZB6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a3Q9QZB6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a3Q9QZB6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a3Q9QZB6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a3Q9QZB6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a3Q9QZB6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a3Q9QZB6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a3Q9QZB6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a3Q9QZB6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a3Q9QZB6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a3Q9QZB6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a3Q9QZB6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nr4a3Q9QZB6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nr4a3Q9QZB6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr4a3Q9QZB6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms