Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Exo1Q9QZ11 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Exo1Q9QZ11 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms