Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndrg3Q9QYF9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms