Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx4Q9QY61 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms