Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp3Q9QY23 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms