Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxe3Q9QY14 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Foxe3Q9QY14 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms