Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx8Q9QXV1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx8Q9QXV1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms