Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg2Q9QXK3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg2Q9QXK3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg2Q9QXK3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg2Q9QXK3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg2Q9QXK3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg2Q9QXK3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg2Q9QXK3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg2Q9QXK3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg2Q9QXK3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg2Q9QXK3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg2Q9QXK3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg2Q9QXK3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg2Q9QXK3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg2Q9QXK3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg2Q9QXK3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg2Q9QXK3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg2Q9QXK3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg2Q9QXK3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg2Q9QXK3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg2Q9QXK3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg2Q9QXK3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg2Q9QXK3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Copg2Q9QXK3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Copg2Q9QXK3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Copg2Q9QXK3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Copg2Q9QXK3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms