Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trp53inp1Q9QXE4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trp53inp1Q9QXE4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms