Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Limd1Q9QXD8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Limd1Q9QXD8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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