Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lsm4Q9QXA5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms