Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mid2Q9QUS6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mid2Q9QUS6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms