Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc2lQ9JME7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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