Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms