Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Rabgef1Q9JM13 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Rabgef1Q9JM13 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Rabgef1Q9JM13 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Rabgef1Q9JM13 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Rabgef1Q9JM13 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Rabgef1Q9JM13 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rabgef1Q9JM13 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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