Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pkd2l2Q9JLG4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms