Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tgm1Q9JLF6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Tgm1Q9JLF6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms