Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF1

Gabrq, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit theta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabrqQ9JLF1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabrqQ9JLF1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GabrqQ9JLF1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GabrqQ9JLF1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GabrqQ9JLF1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms