Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nectin3Q9JLB9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nectin3Q9JLB9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nectin3Q9JLB9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nectin3Q9JLB9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nectin3Q9JLB9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nectin3Q9JLB9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Nectin3Q9JLB9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Nectin3Q9JLB9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Nectin3Q9JLB9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Nectin3Q9JLB9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nectin3Q9JLB9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nectin3Q9JLB9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nectin3Q9JLB9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nectin3Q9JLB9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nectin3Q9JLB9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nectin3Q9JLB9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nectin3Q9JLB9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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