Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Upk3aQ9JKX8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms