Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scamp4Q9JKV5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms