Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Habp4Q9JKS5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Habp4Q9JKS5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Habp4Q9JKS5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Habp4Q9JKS5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Habp4Q9JKS5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Habp4Q9JKS5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Habp4Q9JKS5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Habp4Q9JKS5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Habp4Q9JKS5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Habp4Q9JKS5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Habp4Q9JKS5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Habp4Q9JKS5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Habp4Q9JKS5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Habp4Q9JKS5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Habp4Q9JKS5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Habp4Q9JKS5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms