Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Irx5Q9JKQ4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx5Q9JKQ4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms