Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
AtrQ9JKK8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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