Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx6Q9JKK1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms