Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trem3Q9JKE1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trem3Q9JKE1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms