Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnga3Q9JJZ8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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