Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpf2Q9JJ80 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpf2Q9JJ80 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms