Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX5

Dkc1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkc1Q9ESX5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkc1Q9ESX5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkc1Q9ESX5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms