Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc4Q9ES56 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms