Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ParvbQ9ES46 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms