Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrnb2Q9ERK7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrnb2Q9ERK7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms