Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lima1Q9ERG0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms