Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dap3Q9ER88 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms