Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER80

Rtp4, Receptor-transporting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp4Q9ER80 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rtp4Q9ER80 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtp4Q9ER80 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms