Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clstn2Q9ER65 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clstn2Q9ER65 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clstn2Q9ER65 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms