Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rapgef4Q9EQZ6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rapgef4Q9EQZ6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef4Q9EQZ6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef4Q9EQZ6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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