Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rhox9Q9EQM5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms