Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r29Q9EQ41 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r29Q9EQ41 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms