Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ropn1lQ9EQ00 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ropn1lQ9EQ00 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms