Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc46a3Q9DC26 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc46a3Q9DC26 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms