Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc97Q9DBT3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc97Q9DBT3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms