Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBS1

Tmem43, Transmembrane protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem43Q9DBS1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem43Q9DBS1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem43Q9DBS1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem43Q9DBS1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem43Q9DBS1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms