Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med29Q9DB91 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med29Q9DB91 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 537.6 ms