Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med27Q9DB40 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Med27Q9DB40 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms