Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms