Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sgf29Q9DA08 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgf29Q9DA08 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms