Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cntd1Q9D995 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms