Protein–RNA interactions for Protein: Q9D994

Wdr38, WD repeat-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr38Q9D994 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr38Q9D994 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Wdr38Q9D994 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms